2003-2004 sezonunda Fenerbahçe'ye transfer olan Selçuk, ligde sarı-lacivertli formayı giydiği 99 maçta takımı adına da toplam 8 gole imza attı.
Selçuk'un Fenerbahçe'de oynadığı lig maç sayıları ve attığı goller sezon sezon şöyle:
SEZON MAÇ GOL
2003-2004 25 1
2004-2005 17 -
2005-2006 17 1
2006-2007 6 1
2007-2008 22 2
2008-2009 12 3